<body><div id="__MailbirdStyleContent" style="font-size: 14pt;font-family: Times New Roman;color: #000000">
                                        Hi Tomasz,<div><br></div><div>I set up a virtual machine for Manjaro 19 and was able to reproduce your error (which actually is not causing any issue on Ubuntu that I have been testing the codes on).</div><div><br></div><div>Will look into the issue and get back to you soon.</div><div><br></div><div><span style="font-size: 18.6667px">Cheers,</span></div><div><span style="font-size: 18.6667px">yuanpeng</span> </div><div><br></div><div class="mb_sig">--<div>Dr. Yuanpeng Zhang</div><div>Computational Instrument Scientist</div><div>Oak Ridge National Laboratory (ORNL)</div></div><blockquote class='history_container' type='cite' style='border-left-style:solid;border-width:1px; margin-top:20px; margin-left:0px;padding-left:10px;'>
                        <p style='color: #AAAAAA; margin-top: 10px;'>On 8/18/2020 5:08:08 AM, Stawski, Tomasz via rmcprofile-users <rmcprofile-users@shadow.nd.rl.ac.uk> wrote:</p><div style='font-family:Arial,Helvetica,sans-serif'>Dear all,  <br> <br>I am trying to setup RMCprofile under the current version of Manjaro <br>Linux, and it does not function. I can go through the regular set up <br>processes without issues: <br> <br>input: ./RMCProfile_setup_no_term <br> <br>output: Welcome to RMCProfile version 6.7.7, please use this window to <br>run the programs <br> <br>but when I move to the examples (the same terminal session of course) I <br>am getting weird fortran errors (I think). I have up-to-date gcc <br>fortran.  <br> <br>Could somebody please help me out with this? <br> <br>Cheers, <br>Tomasz <br> <br> <br>Here is the listing: <br> <br> <br>input: rmcprofile rmcsf6_190k <br> <br>output:   <br> <br>Use CPU version <br> <br>--------------------------------------------------------------------- <br>------- <br> <br>            RMCProfile version 6.7.7    <br>            ========================== <br> <br>Version type: Version with molecular constraints and EXAFS <br>Version date: May-18-2020 <br>Release notes: Robust XRAY implementation; automatic weights adjustment <br>Using files: rmcsf6_190k <br> <br>--------------------------------------------------------------------- <br>------- <br> <br> THREADS_numbr =            8 <br> THREADS_id =            4 <br> THREADS_id =            1 <br> THREADS_id =            3 <br> THREADS_id =            6 <br> THREADS_id =            5 <br> THREADS_id =            0 <br> THREADS_id =            2 <br> THREADS_id =            7 <br>No XML/CML output requested <br>Info> Read history file if present <br> Reading configuration file rmcsf6_190k.his6f <br>Info> ntypes,ni: 2 <br>          54         324 <br>Info> Elements in configuration: <br>S  <br>F  <br>Info> Number of atom types = 2 <br>Info> Number of partials = 3 <br> Message> Check the 'MINIMUM_DISTANCES' section <br> Message> in the '.dat' file if program stops here. <br> Message> Check the 'MAXIMUM_MOVES' section <br> Message> in the '.dat' file if program stops here. <br> Sorry, no GPU_ACCELERATOR line in file <br>Material: SF6 <br>Phase: BCC <br>Sample temperature: 190K <br>Investigator: Matt <br>Info> Numbers of data sets (ngr, nsq, nfq) = 1 1 0 <br>Status> Calculating partial weighting coefficients. <br> Message> Check the 'NEUTRON_COEFFICIENTS' section <br> Message> in the '.dat' file if program stops here. <br>Neutron r-space Info> Constant factor assumed to be 1. <br>Neutron r-space Info> Assuming no renormalisation of neutron PDF data <br>required <br>Neutron r-space Info> RESOLUTION_CORRECTION assumed to be zero <br> Neutron r-space Info> Flags for gudrun and stog file types:  F F <br>Info> Norm. exp. for neutron S(Q) file is assumed to be 0 <br>Neutron q-space Info> Constant scale assumed to be 1. <br>Neutron q-space Info> Fitting offset of neutron scattering data <br>required <br>Neutron q-space Info> Assuming no renormalisation of neutron scattering <br>data <br>Neutron q-space Info> Number of points for S(Q) data set 1 is 1186 <br>Warning> Asked to read up to end_point 3000! <br>Neutron q-space Info> Will read all 1186 data points. <br>Neutron q-space Info> Allocated dimension of S(Q) arrays is 1186 <br>Info> sumsqcoeffs,sumiqcoeffs:     0.285588    0.275930 <br>Info> sumsqcoeffs,sumiqcoeffs:     0.285588    0.275930 <br>Info> Number of coordination constraints assumed to be zero <br>Info> Number of average coordination number constraints assumed to be <br>zero <br>Bragg Dummy Info> No Bragg dummy data to be generated. <br>Bragg Info> Will look up scattering lengths normally <br>Bragg Info> Fitted no scale of Bragg data <br> Info> No WEIGHTED_RESIDUAL line in file; traditional fit is assumed <br>... <br>Info> No FAST_BRAGG line in file; traditional fit is assumed ... <br> Info> No EXTENDED_PEAK line in file <br>Info> No magnetic scattering included <br> <br> No atom swap moves will be generated, <br> atoms will only be translated. <br> <br> Since there is no ZMOVESCALE line ZMOVESCALE=1.0 <br> Made it to the start of rmca_main_code <br> Random seed is    920.00000000000000      <br> about to call rmca_list <br> <br> Title of run: (Version 6f format configuration <br>file)                            <br> <br> Configuration contains   378 atoms of 2 types <br> Numbers of each type are: <br>    54   324 <br> <br> Configuration cell vectors are:   8.8302   0.0000   0.0000 <br>                                   0.0000   8.8315   0.0000 <br>                                   0.0000   0.0000   8.8315 <br> <br> Number density is 0.068606 atoms per cubic Angstrom <br> <br> Cut offs in partial g(r)'s are at: <br> 1-1  4.000 Angstrom <br> 1-2  1.200 Angstrom <br> 2-2  1.800 Angstrom <br> <br> Maximum change in any coordinate is 0.0500 A for particles of type 1 <br> Maximum change in any coordinate is 0.1000 A for particles of type 2 <br> <br> Using  441 r points spaced at 0.020 A up to  8.820 A <br> <br> Writing summary every   100 generated moves <br> Programme will run for     0.0 minutes saving every     0.0 minutes <br> <br> Fitting to 1 T(r)'s: <br> <br> Data set 1 uses points    1 to 1500 after subtraction of  0.000 <br> Standard deviation is 0.0500 <br> Coefficients of partials are: <br> 0.00165 0.03942 0.23486 <br> Info> Faber-Ziman Coefficient =   0.27593000000000001      <br> <br> Fitting to 1 S(Q)'s with constant coefficients <br> <br> Data set 1 uses points    1 to 1186 after subtraction of  0.000 <br> Standard deviation is 0.0100 <br> Coefficients of partials are: <br> 0.00165 0.03942 0.23486 <br> Info> Faber-Ziman Coefficient =   0.27593000000000001      <br> <br> There are  0 coordination constraints <br> <br> There are  0 coordination number constraints <br> back from rmca_list <br> <br> Vectors <br>   8.8301540000000003        0.0000000000000000        0.00000000000000 <br>00      <br>   0.0000000000000000        8.8315049999999999        0.00000000000000 <br>00      <br>   0.0000000000000000        0.0000000000000000        8.83150499999999 <br>99      <br> real space cell parameters of supercell <br>   17.66031     17.66301     17.66301     90.00000     90.00000     90. <br>00000 <br> <br>Program received signal SIGILL: Illegal instruction. <br> <br>Backtrace for this error: <br>#0  0x7f76dac732da in ??? <br>#1  0x7f76dac72503 in ??? <br>#2  0x7f76da29a3df in ??? <br>#3  0x7f76da95bba6 in ??? <br>#4  0x5643937103fd in __mod_bragg_MOD_calc_coord <br>        at ../main/rmcprofile_bragg.f90:1094 <br>#5  0x564393800698 in __mod_rmca_MOD_rmca_main_code <br>        at ../main/rmcprofile_rmca.f90:730 <br>#6  0x5643936c4bb7 in rmcprofile <br>        at ../main/rmcprofile.f90:1469 <br>#7  0x56439368f7ee in main <br>        at ../main/rmcprofile.f90:76 <br>Illegal instruction (core dumped) <br> <br>_______________________________________________ <br>rmcprofile-users mailing list <br>rmcprofile-users@rmcprofile.org <br>http://lists.rmcprofile.org/mailman/listinfo/rmcprofile-users <br></div></blockquote>
                                        </div></body>